24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12981 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  31.4 
 
 
197 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  29.17 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  45.31 
 
 
643 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
974 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  38.1 
 
 
403 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  28.45 
 
 
204 aa  51.2  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  27.22 
 
 
172 aa  51.6  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
393 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  36.9 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.25 
 
 
764 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  31.85 
 
 
1124 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  30.91 
 
 
309 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
281 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
178 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  34.18 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  24.82 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
278 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  23.48 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  35.19 
 
 
417 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
364 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
301 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>