63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12521 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  84.53 
 
 
434 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  84.3 
 
 
434 aa  713    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  83.37 
 
 
434 aa  729    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  73.44 
 
 
435 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  71.26 
 
 
437 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  71.03 
 
 
437 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  65.26 
 
 
431 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  64.95 
 
 
460 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  36.99 
 
 
421 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  37.77 
 
 
433 aa  257  4e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  37.59 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  38.9 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  37.35 
 
 
428 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  36.99 
 
 
425 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  36.24 
 
 
424 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  37.41 
 
 
424 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  37.82 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  37.17 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  37.17 
 
 
424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  36.93 
 
 
424 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  34.61 
 
 
428 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  36.93 
 
 
424 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  34.61 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  38.94 
 
 
452 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  37.02 
 
 
421 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  36.01 
 
 
433 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  34.36 
 
 
421 aa  233  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  34.69 
 
 
423 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  35.93 
 
 
420 aa  230  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  35.34 
 
 
421 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  34.68 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  35.54 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  34.59 
 
 
422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  34.51 
 
 
382 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  32.62 
 
 
421 aa  209  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  31.91 
 
 
427 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  30.44 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  35.01 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  23.93 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  22.8 
 
 
442 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  20.2 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  24.46 
 
 
440 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  20.44 
 
 
415 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  21.5 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  22.38 
 
 
468 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  23.67 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  22.1 
 
 
508 aa  53.5  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  26.59 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  26.35 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.18 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  23.08 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  27.27 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  28.1 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  20.52 
 
 
432 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  25.79 
 
 
435 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  18.53 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  33.65 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  24.84 
 
 
429 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.68 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  26.92 
 
 
428 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  35.71 
 
 
418 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  64.71 
 
 
52 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>