More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09591 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.33 
 
 
1132 aa  732    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  37.03 
 
 
1149 aa  732    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  43.32 
 
 
1154 aa  1029    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  41.72 
 
 
1181 aa  939    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  37.26 
 
 
1136 aa  732    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  82.69 
 
 
1188 aa  2027    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.25 
 
 
1132 aa  733    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  41.81 
 
 
1193 aa  943    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.16 
 
 
1132 aa  721    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.16 
 
 
1133 aa  722    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.16 
 
 
1133 aa  723    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  42.54 
 
 
1171 aa  979    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  44.51 
 
 
1158 aa  1053    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  63.88 
 
 
1182 aa  1535    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  63.94 
 
 
1182 aa  1539    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  82.69 
 
 
1188 aa  2030    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  34.47 
 
 
1189 aa  739    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  58.99 
 
 
1178 aa  1417    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  42.86 
 
 
1151 aa  947    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  43.04 
 
 
1199 aa  979    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  58.87 
 
 
1191 aa  1440    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  43.49 
 
 
1195 aa  990    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  59.75 
 
 
1208 aa  1523    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  59.28 
 
 
1208 aa  1529    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  44.74 
 
 
1184 aa  1032    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  59.38 
 
 
1183 aa  1443    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  43.63 
 
 
1215 aa  1010    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.16 
 
 
1132 aa  721    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.41 
 
 
1163 aa  833    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  82.83 
 
 
1188 aa  2052    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  58.26 
 
 
1190 aa  1438    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  35.54 
 
 
1196 aa  738    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  44.22 
 
 
1182 aa  972    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  36.24 
 
 
1150 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  58.62 
 
 
1191 aa  1435    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  36 
 
 
1180 aa  759    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  34.36 
 
 
1254 aa  728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  43.15 
 
 
1223 aa  1011    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.16 
 
 
1132 aa  721    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  36.27 
 
 
1150 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  62.5 
 
 
1191 aa  1542    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  59.31 
 
 
1214 aa  1503    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  44.15 
 
 
1157 aa  1021    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  43.4 
 
 
1178 aa  1023    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.16 
 
 
1132 aa  721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.42 
 
 
1132 aa  731    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  41.5 
 
 
1214 aa  912    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  37.28 
 
 
1136 aa  727    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.01 
 
 
1132 aa  736    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  33.39 
 
 
1208 aa  720    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  42.71 
 
 
1168 aa  994    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  100 
 
 
1187 aa  2421    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  43.83 
 
 
1169 aa  1009    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  58 
 
 
1197 aa  1419    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  56.7 
 
 
1224 aa  1408    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  44.21 
 
 
1154 aa  1041    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  40.59 
 
 
1156 aa  853    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  43.67 
 
 
1156 aa  1009    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  43.22 
 
 
1173 aa  996    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  40.55 
 
 
1216 aa  904    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  41.39 
 
 
1176 aa  964    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  42.88 
 
 
1167 aa  989    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  58.84 
 
 
1176 aa  1444    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  43.86 
 
 
1158 aa  1011    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  43.69 
 
 
1192 aa  1012    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  36.27 
 
 
1150 aa  741    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  36.31 
 
 
1169 aa  728    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  57.67 
 
 
1212 aa  1437    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  37.42 
 
 
1132 aa  725    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  43.47 
 
 
1171 aa  986    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  32.05 
 
 
1266 aa  596  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  31.16 
 
 
1257 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  31 
 
 
1257 aa  549  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  29.84 
 
 
1236 aa  546  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  30.5 
 
 
1261 aa  539  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  30.79 
 
 
1264 aa  538  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  30.59 
 
 
1261 aa  539  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  30.55 
 
 
1261 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  29.8 
 
 
1251 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  30.54 
 
 
1232 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  30.16 
 
 
1261 aa  530  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  30.01 
 
 
1232 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  30.66 
 
 
1230 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  30.58 
 
 
1251 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  31.46 
 
 
1257 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  29.77 
 
 
1257 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  30.51 
 
 
1227 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  30.58 
 
 
1230 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  30.25 
 
 
1220 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  28.93 
 
 
1243 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  30.58 
 
 
1231 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  30.56 
 
 
1274 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  31.45 
 
 
1251 aa  525  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  31.18 
 
 
1219 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  29.58 
 
 
1271 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  30.51 
 
 
1263 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  30.8 
 
 
1244 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  30.31 
 
 
1264 aa  526  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  30.31 
 
 
1264 aa  526  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  29.73 
 
 
1227 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>