More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_08181 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  100 
 
 
312 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  82.85 
 
 
309 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  80.91 
 
 
309 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  79.94 
 
 
309 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  58.2 
 
 
315 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  57.83 
 
 
315 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  56.95 
 
 
304 aa  347  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  55.96 
 
 
304 aa  340  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  58.61 
 
 
318 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  58.25 
 
 
311 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  51.25 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  48.78 
 
 
328 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  48.69 
 
 
351 aa  278  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.82 
 
 
349 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.1 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.1 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.38 
 
 
350 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  45.51 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  43.21 
 
 
295 aa  231  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.3 
 
 
283 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  39.41 
 
 
283 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  45.15 
 
 
282 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  43.46 
 
 
284 aa  185  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  43.28 
 
 
284 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.15 
 
 
282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  38.19 
 
 
284 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  41.77 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.62 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.62 
 
 
282 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  37.95 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  40.76 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  36.03 
 
 
278 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.6 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  37.14 
 
 
271 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  37.9 
 
 
276 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.37 
 
 
271 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.96 
 
 
271 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  37.76 
 
 
271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  37.65 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.44 
 
 
271 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  38.46 
 
 
271 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.4 
 
 
283 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.16 
 
 
258 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.13 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  35.29 
 
 
352 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  35.29 
 
 
395 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.29 
 
 
395 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 
391 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.09 
 
 
405 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.43 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  34.48 
 
 
1076 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.71 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 
396 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.46 
 
 
446 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.78 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  34.39 
 
 
403 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  35.15 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 
396 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  32.62 
 
 
378 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.78 
 
 
396 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.39 
 
 
401 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.78 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.97 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.03 
 
 
454 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  31.6 
 
 
463 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  34.39 
 
 
396 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  34.39 
 
 
396 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  34.39 
 
 
396 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.39 
 
 
405 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  34.39 
 
 
396 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  34.39 
 
 
396 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  34.39 
 
 
396 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  34.39 
 
 
408 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  34.87 
 
 
395 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.87 
 
 
395 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.61 
 
 
390 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 
401 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  33.99 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  31.62 
 
 
465 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  34.25 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  34.27 
 
 
255 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.6 
 
 
438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30 
 
 
444 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  30 
 
 
444 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.38 
 
 
339 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.61 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  39.77 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  31.34 
 
 
444 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.07 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.19 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.98 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.88 
 
 
309 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.91 
 
 
1081 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  30.4 
 
 
341 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  30.23 
 
 
442 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  57 
 
 
472 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.91 
 
 
1081 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  34.98 
 
 
1081 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>