57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05661 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  70.47 
 
 
141 aa  220  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  71.14 
 
 
141 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  71.14 
 
 
141 aa  217  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  50.98 
 
 
153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  46.31 
 
 
145 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 
145 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  41.67 
 
 
168 aa  144  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  44.23 
 
 
152 aa  144  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  45 
 
 
160 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  40.79 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  49.53 
 
 
165 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  48.48 
 
 
160 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  48.48 
 
 
160 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  41.23 
 
 
219 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  44.44 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  45.37 
 
 
180 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  41 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  29.36 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  29.36 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  29.36 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  21.05 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  25.16 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  22 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  27.62 
 
 
275 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  22.31 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  23.08 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  24.51 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  20.39 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  29.7 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  24.76 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  18.27 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  23.3 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  25.47 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1650  single-strand binding protein  22.86 
 
 
146 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  24.3 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  23.6 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  25.53 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  26.53 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  23.12 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  22.86 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  21.66 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  21.9 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  21.66 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  27.72 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  24.52 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  24.76 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>