More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05371 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  77.78 
 
 
479 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  77.15 
 
 
476 aa  748    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  76.94 
 
 
476 aa  747    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 
492 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
492 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
476 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
476 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
477 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
477 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
481 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
881 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
481 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
481 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
481 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
482 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
483 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
483 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 
479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
482 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
490 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
470 aa  323  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
488 aa  323  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
465 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
490 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
477 aa  321  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
488 aa  320  3e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
494 aa  319  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
480 aa  319  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
464 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
490 aa  316  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
467 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
467 aa  315  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 
478 aa  315  9e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
466 aa  315  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
459 aa  312  9e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
463 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
466 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
463 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
466 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
491 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
486 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
467 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
466 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
468 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
463 aa  310  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
488 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
464 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
459 aa  309  9e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
469 aa  309  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
473 aa  307  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
470 aa  304  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
483 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
460 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
485 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
485 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
485 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
485 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
485 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
496 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
485 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
470 aa  302  9e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
491 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
475 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
462 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
480 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
475 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
474 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
471 aa  299  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
474 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
501 aa  299  8e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
468 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
509 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
499 aa  298  1e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
469 aa  298  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
481 aa  298  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>