More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04761 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  89.26 
 
 
391 aa  714  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  91.52 
 
 
390 aa  729  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  92.33 
 
 
391 aa  719  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  100 
 
 
391 aa  792  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  46.39 
 
 
391 aa  398  1e-110  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  49.11 
 
 
400 aa  399  1e-110  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  45.8 
 
 
428 aa  399  1e-110  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  50 
 
 
400 aa  399  1e-110  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  45.36 
 
 
388 aa  388  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  43.81 
 
 
400 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  38.72 
 
 
392 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  35.37 
 
 
415 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  34.7 
 
 
404 aa  253  4e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  34.88 
 
 
395 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  34.88 
 
 
395 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  35.49 
 
 
401 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  1.72014e-07 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  34.55 
 
 
387 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  25.19 
 
 
367 aa  142  1e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  26.11 
 
 
374 aa  132  1e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  25.7 
 
 
379 aa  131  2e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  22.56 
 
 
372 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  23.68 
 
 
363 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  24.19 
 
 
287 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.91 
 
 
368 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  21.59 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  25.53 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.15 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  27.12 
 
 
462 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.23 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  25.9 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25.77 
 
 
376 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  25.9 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.92 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  25.48 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  25.48 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  25.48 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  27.19 
 
 
461 aa  87  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.3 
 
 
666 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  22.47 
 
 
377 aa  85.5  1e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  24.6 
 
 
406 aa  85.9  1e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  24.6 
 
 
406 aa  85.9  1e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  24.6 
 
 
406 aa  85.9  1e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  24.6 
 
 
406 aa  85.9  1e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  25.95 
 
 
425 aa  85.5  1e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  21.68 
 
 
393 aa  85.5  1e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.95 
 
 
650 aa  85.5  1e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  24.57 
 
 
387 aa  84.7  2e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  25.86 
 
 
682 aa  84.7  2e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  22.17 
 
 
393 aa  85.1  2e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  25.26 
 
 
688 aa  84.3  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  24.68 
 
 
412 aa  84.3  4e-15  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  25.16 
 
 
420 aa  83.6  6e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  25.26 
 
 
666 aa  83.2  7e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  26.27 
 
 
660 aa  82.8  9e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  26.27 
 
 
660 aa  82.8  9e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  26.27 
 
 
660 aa  82.8  9e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  26.27 
 
 
671 aa  82.8  1e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.57 
 
 
408 aa  82.4  1e-14  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.77 
 
 
412 aa  82.4  1e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  25.64 
 
 
661 aa  82.8  1e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  26.27 
 
 
660 aa  82  2e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.31 
 
 
377 aa  82  2e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.23228e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.81 
 
 
608 aa  82  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  26.27 
 
 
685 aa  82  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  26.27 
 
 
660 aa  82  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.58 
 
 
410 aa  80.9  3e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.01 
 
 
421 aa  81.3  3e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  7.71215e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  27.8 
 
 
380 aa  80.9  3e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  19.08 
 
 
413 aa  81.3  3e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.7 
 
 
413 aa  81.3  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.7 
 
 
413 aa  81.3  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.82 
 
 
406 aa  81.3  3e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.71 
 
 
678 aa  80.9  4e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  22.28 
 
 
381 aa  80.5  4e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  21.63 
 
 
377 aa  80.1  5e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.75 
 
 
414 aa  80.1  6e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.93 
 
 
412 aa  80.1  7e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.52 
 
 
406 aa  79.7  8e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  20.33 
 
 
429 aa  79.7  9e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.04 
 
 
429 aa  79  1e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.03 
 
 
629 aa  79.3  1e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.2 
 
 
408 aa  79.3  1e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  21.04 
 
 
388 aa  79.3  1e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  5.51025e-06  unclonable  4.45037e-08 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  23.14 
 
 
376 aa  79  1e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  23.24 
 
 
469 aa  78.6  2e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  25.9 
 
 
419 aa  78.6  2e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.4 
 
 
387 aa  77.8  3e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.13 
 
 
415 aa  77.8  3e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  21.45 
 
 
401 aa  77.8  3e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  19.67 
 
 
429 aa  77.4  4e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.46 
 
 
378 aa  77.4  4e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.52 
 
 
406 aa  77.4  4e-13  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  19.67 
 
 
429 aa  77.4  4e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  25 
 
 
401 aa  77.4  4e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  25.29 
 
 
406 aa  77  5e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  21.37 
 
 
390 aa  77  5e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  21.95 
 
 
407 aa  77  5e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  27.49 
 
 
381 aa  77  6e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  21.79 
 
 
388 aa  77  6e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.29 
 
 
630 aa  76.6  6e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>