More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04561 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  73.46 
 
 		 211 aa  317  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  72.38 
 
 		 211 aa  310  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  70.53 
 
 		 190 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  54.63 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  55.12 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  52.6 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  55.1 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  54.08 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  50.76 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  43.33 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  42.58 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  42.53 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 222 aa  171  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  39.81 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  40.95 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  39.9 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  39.51 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  39.81 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.68 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  40.5 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.25 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  39.5 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.87 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  40.78 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.78 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  35.78 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  37.33 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  35.64 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.79 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  35.55 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  37.93 
 
 		 241 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  37.8 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  38.39 
 
 		 268 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  42.16 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.54 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  39.02 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  37.91 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  37.8 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  37.8 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  37.33 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.83 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  37.79 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  37 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.41 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  36.27 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  38.83 
 
 		 239 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  35.55 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  38.35 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  34.31 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  34.86 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  36.97 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  38.76 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  37.8 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  37.38 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.9 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  35.1 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.24 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  36.71 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  37.24 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3346  hypothetical protein  36.84 
 
 		 305 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  33.82 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.45 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3299  hypothetical protein  36.84 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  33.63 
 
 		 237 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3333  hypothetical protein  36.84 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  35.68 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2655  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  38.65 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  34.38 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  35.35 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  35.41 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  33.64 
 
 		 241 aa  121  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  37.79 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  32.84 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  35.78 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  34.29 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  38.38 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  35.86 
 
 		 250 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  36.32 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  33.94 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  31.55 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  33.67 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  34.12 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  35.75 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  37.02 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  33.04 
 
 		 237 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>