More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03191 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  100 
 
 
186 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  81.87 
 
 
187 aa  301  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  80.43 
 
 
187 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  80.9 
 
 
187 aa  296  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
186 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
186 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  56.65 
 
 
186 aa  214  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  58.38 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  57.65 
 
 
189 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
189 aa  200  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 
182 aa  187  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  52.12 
 
 
184 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 
195 aa  174  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  53.61 
 
 
183 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 
183 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  49.71 
 
 
183 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  51.23 
 
 
184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  40.94 
 
 
185 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
186 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  38.89 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  37.65 
 
 
171 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
192 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
180 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
180 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
164 aa  104  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  38 
 
 
187 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
176 aa  101  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
178 aa  101  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
169 aa  98.6  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  37.75 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  32.45 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
164 aa  94.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
166 aa  94.7  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
172 aa  94.7  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
173 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.56 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.56 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.56 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  35.06 
 
 
171 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.56 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  34.25 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  33.56 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  33.56 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  33.56 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
169 aa  92  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
173 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  35.48 
 
 
179 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
178 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1768  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
175 aa  91.3  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00835912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  30.91 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  29.38 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  34.16 
 
 
335 aa  89.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.43 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
281 aa  89  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  34.44 
 
 
179 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.14 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
190 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  31.76 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 
210 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>