More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_02361 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  41.06 
 
 		 863 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0030  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.05 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  45.67 
 
 		 865 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  45.13 
 
 		 874 aa  636    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2225  ATPase  47.07 
 
 		 867 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00451076 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0564  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  39.85 
 
 		 869 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02831  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  51.23 
 
 		 931 aa  896    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06361  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  41.9 
 
 		 863 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  46.49 
 
 		 862 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1287  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  40.84 
 
 		 866 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  47.15 
 
 		 861 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  41.34 
 
 		 872 aa  701    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  45.45 
 
 		 879 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02251  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  50.64 
 
 		 920 aa  895    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260089  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1090  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  40.58 
 
 		 866 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.930784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1072  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  40.58 
 
 		 866 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02271  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  75.98 
 
 		 918 aa  1342    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.05 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  46.74 
 
 		 858 aa  648    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  46.74 
 
 		 858 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  48.17 
 
 		 871 aa  672    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  40.8 
 
 		 893 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.29 
 
 		 863 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  47.5 
 
 		 824 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0016  ATPase  42.87 
 
 		 863 aa  681    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1574  ATPase  51.13 
 
 		 931 aa  893    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.513125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  47.47 
 
 		 871 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0120  ATPase  46.23 
 
 		 863 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000637349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  40.2 
 
 		 891 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  42.64 
 
 		 873 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  42.15 
 
 		 876 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  42.31 
 
 		 872 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  46.05 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  46.11 
 
 		 865 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1249  ATPase  46.93 
 
 		 869 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.748877  decreased coverage  0.00497256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  39.49 
 
 		 870 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  45.08 
 
 		 867 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  45.91 
 
 		 865 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  40.2 
 
 		 862 aa  694    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2159  ATPase  46.41 
 
 		 941 aa  859    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.513244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  40.92 
 
 		 862 aa  675    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2474  ATPase  47.73 
 
 		 924 aa  880    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.786045  normal  0.0534702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  46.41 
 
 		 864 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  38.03 
 
 		 874 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1177  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  40.58 
 
 		 866 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0209  ATPase  77.01 
 
 		 918 aa  1395    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0637  ATPase  42.34 
 
 		 895 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0120026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  40.83 
 
 		 883 aa  706    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  46.21 
 
 		 869 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  39.59 
 
 		 870 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.19 
 
 		 865 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  40.46 
 
 		 870 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2223  ATPase AAA-2  46.05 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  40.72 
 
 		 879 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  46.2 
 
 		 870 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1867  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.05 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  44.99 
 
 		 874 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  40.61 
 
 		 863 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  38.99 
 
 		 871 aa  637    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  45.8 
 
 		 870 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  46.21 
 
 		 879 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  46.24 
 
 		 861 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  46.66 
 
 		 866 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  45.78 
 
 		 865 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1426  ATP-dependent chaperone ClpB  45.91 
 
 		 865 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814742  hitchhiker  0.00462707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  46.27 
 
 		 879 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1138  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.05 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  39.5 
 
 		 878 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  46.63 
 
 		 879 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0836  ATP-dependent chaperone ClpB  48.32 
 
 		 860 aa  654    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00212148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  45.07 
 
 		 878 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  46.93 
 
 		 861 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27741  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  49.78 
 
 		 926 aa  886    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0974  ATPase  44.87 
 
 		 869 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  39.4 
 
 		 859 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  46.24 
 
 		 865 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  38.61 
 
 		 878 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  48.1 
 
 		 858 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1871  ATP-dependent chaperone ClpB  46.1 
 
 		 865 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  hitchhiker  0.00068735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  41.36 
 
 		 870 aa  689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3490  ATPase AAA-2  41.77 
 
 		 905 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  38.7 
 
 		 865 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0993  ATPase  44.87 
 
 		 869 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24612  chaperone, Hsp100 family, ClpB-type  38.98 
 
 		 923 aa  664    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.311804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1757  ATP-dependent chaperone ClpB  46.1 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786862  normal  0.0714253 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02251  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  76.11 
 
 		 920 aa  1374    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  46.12 
 
 		 868 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  46.1 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1210  ATP-dependent chaperone ClpB  46.77 
 
 		 862 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890836  normal  0.0751244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1549  putative ATP-dependent protease (heat shock protein)  46.67 
 
 		 867 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0075  ATPase  39.49 
 
 		 870 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0715422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  46.24 
 
 		 865 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  48.5 
 
 		 859 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  39.49 
 
 		 880 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2261  clpB protein  46.05 
 
 		 865 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342384  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02361  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  100 
 
 		 915 aa  1819    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  40.35 
 
 		 870 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  40.02 
 
 		 879 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  47.75 
 
 		 857 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  39.54 
 
 		 867 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>