More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01611 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  82.44 
 
 		 449 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  83.93 
 
 		 450 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 450 aa  906    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  85.11 
 
 		 450 aa  779    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  54.15 
 
 		 459 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  53.93 
 
 		 459 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  53.83 
 
 		 461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  48.91 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26521  DNA repair protein RadA  51.9 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  45.15 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  46.38 
 
 		 517 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  46.25 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  46.25 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  45.36 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 507 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  42.46 
 
 		 518 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  45.37 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  44.98 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  45.22 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  44.57 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  45.43 
 
 		 458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  48.94 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  45.88 
 
 		 449 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  41.52 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  43.82 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  47.24 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  44.94 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  43.37 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  43.7 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  42.95 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  41.76 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  43.47 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  43.84 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  43.08 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  45.43 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  43.82 
 
 		 470 aa  383  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  43.36 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  43.53 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  41.74 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  43.86 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  43.21 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  41.09 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  43.6 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  40.76 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  43.08 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  42.54 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  40.76 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  41.12 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  43.93 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  41.79 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.32 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  40.69 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  42.57 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  41.8 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  42.46 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  41.86 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  39.73 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  44.49 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  44.49 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  43.19 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  48.94 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  41.22 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  41.63 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  39.82 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  41.1 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  40.83 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  41.14 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3219  DNA repair protein RadA  41.14 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  41.14 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  41.59 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3219  DNA repair protein RadA  41.14 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  39.51 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  43.4 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  41.33 
 
 		 449 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 450 aa  362  7.0000000000000005e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  41.15 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  39.87 
 
 		 455 aa  362  8e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>