More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01561 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  91.54 
 
 
260 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  91.54 
 
 
260 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  91.54 
 
 
260 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  86.17 
 
 
265 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  85.77 
 
 
265 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  85.83 
 
 
259 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  82.73 
 
 
258 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  84.58 
 
 
262 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  81.67 
 
 
268 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  70.28 
 
 
249 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.35 
 
 
246 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.35 
 
 
246 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.8 
 
 
246 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  74.78 
 
 
247 aa  363  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  69.84 
 
 
257 aa  363  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  73.91 
 
 
247 aa  357  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.37 
 
 
263 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 
226 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 
225 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 
231 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  39.06 
 
 
248 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 
248 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 
230 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  39.06 
 
 
248 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  39.48 
 
 
248 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 
235 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 
226 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.63 
 
 
247 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 
231 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
239 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
245 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 
259 aa  175  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 
232 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 
234 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 
228 aa  174  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  37.34 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  37.34 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  38.98 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  38.98 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  38.98 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  38.98 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  38.98 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  38.98 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  38.98 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.34 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  38.98 
 
 
235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  38.98 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 
227 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 
230 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 
229 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 
234 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 
236 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  37.34 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 
243 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.91 
 
 
243 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 
243 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  38.63 
 
 
248 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  37.77 
 
 
248 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 
248 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 
226 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 
235 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 
225 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 
233 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 
228 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 
232 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 
229 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  40.51 
 
 
239 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.51 
 
 
239 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.51 
 
 
239 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.51 
 
 
239 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.51 
 
 
239 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  40.51 
 
 
239 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  39.17 
 
 
240 aa  168  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.08 
 
 
239 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  39.48 
 
 
236 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 
225 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 
226 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 
235 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
226 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  39.15 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  40.33 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  38.82 
 
 
238 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>