More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00661 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  46.17 
 
 
1184 aa  991    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  100 
 
 
1194 aa  2386    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  36.81 
 
 
1217 aa  717    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  48.33 
 
 
1183 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  76.38 
 
 
1196 aa  1801    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  48.52 
 
 
1201 aa  1033    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  46.12 
 
 
1204 aa  1025    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  45.96 
 
 
1202 aa  999    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  77.47 
 
 
1196 aa  1826    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  38.34 
 
 
1226 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  48.07 
 
 
1207 aa  1033    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  36.7 
 
 
1198 aa  686    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  76.55 
 
 
1196 aa  1809    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  37.97 
 
 
1190 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  36.88 
 
 
1219 aa  724    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 
1226 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  33.44 
 
 
1175 aa  505  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  41.94 
 
 
1208 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  31.96 
 
 
1171 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  32.12 
 
 
1174 aa  480  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  29.14 
 
 
1192 aa  466  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  30.18 
 
 
1189 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  29.93 
 
 
1193 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  29.86 
 
 
1146 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30.57 
 
 
1149 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 
1147 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  30.34 
 
 
1146 aa  406  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  28.91 
 
 
1191 aa  376  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.11 
 
 
1189 aa  369  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  28.29 
 
 
1189 aa  364  6e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 
1172 aa  363  9e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 
1189 aa  357  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 
1189 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.74 
 
 
1185 aa  321  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  61.18 
 
 
1195 aa  314  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  31.82 
 
 
1146 aa  305  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.65 
 
 
1187 aa  294  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.14 
 
 
1190 aa  278  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 
1188 aa  277  9e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 
1188 aa  277  9e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.74 
 
 
1184 aa  268  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  25.12 
 
 
1189 aa  261  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 
1189 aa  260  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.04 
 
 
1189 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.25 
 
 
1191 aa  256  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.26 
 
 
1189 aa  255  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.42 
 
 
1185 aa  254  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 
1190 aa  251  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  25.27 
 
 
1187 aa  250  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.2 
 
 
1196 aa  249  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1177 aa  242  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  25.34 
 
 
1174 aa  235  4.0000000000000004e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1148 aa  231  8e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.14 
 
 
1184 aa  230  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.01 
 
 
1134 aa  228  8e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  23.69 
 
 
1177 aa  226  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.92 
 
 
1170 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.82 
 
 
1191 aa  221  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  23.28 
 
 
1187 aa  221  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.78 
 
 
1199 aa  221  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.74 
 
 
1180 aa  218  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  32.46 
 
 
1188 aa  218  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 
1199 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.51 
 
 
1199 aa  214  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  23.56 
 
 
1176 aa  212  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.35 
 
 
1148 aa  207  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.52 
 
 
1185 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  23.58 
 
 
1186 aa  206  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  39.5 
 
 
1196 aa  204  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.5 
 
 
1181 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.03 
 
 
1215 aa  201  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  24.29 
 
 
1178 aa  199  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  22.71 
 
 
1201 aa  198  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  26.55 
 
 
1082 aa  196  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  27.96 
 
 
1174 aa  191  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26.02 
 
 
1189 aa  189  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26.02 
 
 
1189 aa  189  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.02 
 
 
1189 aa  187  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.02 
 
 
1189 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.89 
 
 
1189 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.02 
 
 
1189 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  25.89 
 
 
1189 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl232  structural maintenance of chromosomes smc superfamily protein  24.02 
 
 
995 aa  182  2e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 
1185 aa  183  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.94 
 
 
1174 aa  183  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  27.13 
 
 
1185 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 
1185 aa  181  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  22.23 
 
 
1176 aa  181  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 
1170 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 
1198 aa  175  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.23 
 
 
1164 aa  170  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  28.01 
 
 
1175 aa  168  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  25.54 
 
 
1187 aa  167  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  24.74 
 
 
1208 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22.8 
 
 
1403 aa  164  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  21.34 
 
 
1175 aa  162  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  24.49 
 
 
1209 aa  151  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 
1204 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.15 
 
 
1178 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.61 
 
 
1476 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>