More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00141 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  343  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  82.93 
 
 
164 aa  292  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  81.1 
 
 
164 aa  288  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  81.1 
 
 
164 aa  283  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  61.78 
 
 
167 aa  227  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  63.06 
 
 
168 aa  221  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  64.81 
 
 
168 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  64.14 
 
 
155 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  63.45 
 
 
155 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  70.73 
 
 
168 aa  204  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  55 
 
 
157 aa  188  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  57.75 
 
 
202 aa  183  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  55.41 
 
 
168 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  59.09 
 
 
161 aa  177  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  48.77 
 
 
166 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  53.29 
 
 
161 aa  175  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  51.06 
 
 
164 aa  174  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
158 aa  171  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  50.31 
 
 
164 aa  170  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
137 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.38 
 
 
166 aa  170  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  56.39 
 
 
137 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 
176 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  58.78 
 
 
176 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 
176 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  49.08 
 
 
167 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  58.68 
 
 
161 aa  167  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  59.09 
 
 
165 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  58.14 
 
 
176 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  49.37 
 
 
160 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  50.93 
 
 
164 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  55.97 
 
 
198 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 
138 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 
138 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  60.98 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  48.45 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
138 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
138 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
161 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  57.58 
 
 
165 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  60.83 
 
 
136 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  54.07 
 
 
171 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
138 aa  160  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
166 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  58.54 
 
 
130 aa  158  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
167 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  62.5 
 
 
163 aa  157  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  58.06 
 
 
157 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
190 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 
174 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  51.45 
 
 
171 aa  153  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  56.56 
 
 
167 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  50.98 
 
 
180 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  49.67 
 
 
180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 
142 aa  149  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 
183 aa  147  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  55.75 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 
135 aa  145  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  60.38 
 
 
156 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  56.2 
 
 
155 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  57.76 
 
 
229 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  56.2 
 
 
136 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
137 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  53.33 
 
 
151 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  57.02 
 
 
136 aa  142  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 
140 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  52.03 
 
 
138 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  52.42 
 
 
135 aa  140  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 
185 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  41.98 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  53.72 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  54.47 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 
133 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  49.59 
 
 
148 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  51.24 
 
 
136 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  52.07 
 
 
136 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
159 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  50.37 
 
 
147 aa  137  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  49.6 
 
 
140 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  51.24 
 
 
132 aa  137  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  48.48 
 
 
136 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  51.22 
 
 
133 aa  136  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  53.73 
 
 
148 aa  136  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 
139 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 
137 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  51.64 
 
 
131 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 
138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  52.46 
 
 
144 aa  134  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  46.56 
 
 
142 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  52.5 
 
 
154 aa  134  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
146 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>