More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_30021 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  81.72 
 
 		 285 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  73.31 
 
 		 284 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  79.57 
 
 		 284 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  67.38 
 
 		 284 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  67.03 
 
 		 284 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  61.15 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  60.79 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  61.15 
 
 		 284 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  58.99 
 
 		 284 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  57.97 
 
 		 284 aa  348  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  59.21 
 
 		 284 aa  346  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 284 aa  345  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  57.25 
 
 		 284 aa  345  5e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  55.96 
 
 		 284 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  55.96 
 
 		 284 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 289 aa  298  9e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 		 287 aa  285  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 284 aa  278  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 		 296 aa  275  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  48.59 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 309 aa  271  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  50.91 
 
 		 285 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 295 aa  258  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  42.2 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  43.64 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  44.67 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  44.26 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 		 286 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  44.8 
 
 		 287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  42.5 
 
 		 284 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  42.09 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  42.65 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  44.24 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  43 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  44.44 
 
 		 287 aa  234  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 280 aa  234  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  43.12 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  45.33 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  44.13 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  44.8 
 
 		 289 aa  232  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  46.71 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  44.13 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  45.61 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  44.52 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  44.8 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  42.36 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  44.72 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  43.53 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  42.6 
 
 		 283 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  43.37 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  40.43 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  42.76 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  43.73 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  43.32 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  44.29 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  44.84 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  41.57 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  43.77 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  44.25 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  43.73 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  42.25 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  43.66 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  44.44 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>