More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29531 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 374 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  70.3 
 
 		 365 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  67.57 
 
 		 375 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.22 
 
 		 372 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.45 
 
 		 359 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.95 
 
 		 372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.99 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.37 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.01 
 
 		 372 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.37 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.54 
 
 		 381 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.49 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.4 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.95 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.41 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  49.18 
 
 		 378 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1780  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.68 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  50.82 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  47.17 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.71 
 
 		 360 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.31 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.3 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.03 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.97 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  41.51 
 
 		 357 aa  292  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  40.48 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.52 
 
 		 366 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  42.74 
 
 		 363 aa  288  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.63 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.4 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.26 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.26 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.4 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.99 
 
 		 366 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.99 
 
 		 366 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  39.49 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.99 
 
 		 366 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.99 
 
 		 366 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  43.01 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.57 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.4 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  40.8 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  43.09 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.8 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.8 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.47 
 
 		 366 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.32 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  38.17 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.47 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  40.91 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 359 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.58 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 		 361 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.44 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3329  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.62 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.73 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.43 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  40.38 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  41.44 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  40.8 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0143  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.53 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.397791 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  41.78 
 
 		 360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994.1  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0127  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3997  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3061  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3926  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1542  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  38.24 
 
 		 371 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  37.37 
 
 		 360 aa  264  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3293  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.41 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  41.58 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  39.52 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0056  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.74 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3480  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.58 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.52 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0133  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.01 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0145  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.01 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.731192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.42 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3325  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.01 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3255  glycine cleavage system T protein  41.8 
 
 		 584 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  42.2 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  37.33 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  39.25 
 
 		 366 aa  262  6.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0159  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.53 
 
 		 372 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  40.96 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.61 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.02 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2909  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.53 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0867  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.75 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0146  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.53 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3880  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.21 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0331  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.58 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>