More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29191 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  100 
 
 
121 aa  251  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  71.07 
 
 
121 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  66.41 
 
 
128 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  66.41 
 
 
128 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  64.17 
 
 
122 aa  170  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  63.33 
 
 
125 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  55.83 
 
 
122 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  58.62 
 
 
122 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  58.62 
 
 
122 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  57.5 
 
 
122 aa  143  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  54.17 
 
 
122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  51.67 
 
 
122 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  47.11 
 
 
124 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  53.39 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  46.28 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  46.28 
 
 
124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  45.45 
 
 
124 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  47.5 
 
 
122 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  43.93 
 
 
106 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  49.04 
 
 
105 aa  102  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  44.34 
 
 
107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  45.28 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  43.4 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  43.4 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  46.74 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  41.51 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  43.69 
 
 
111 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  42.11 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  38.54 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  38.54 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  38.54 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  38.54 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  38.54 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  38.78 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  36.73 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  38.54 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  38.54 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  37.5 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  39.58 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  39.58 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  40.22 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  35.85 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  39 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  37.5 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  37.89 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  37.5 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  38.2 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  37.08 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  36.84 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  37 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  41.98 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  35 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  35 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  36 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  34.34 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  43.04 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  36.25 
 
 
94 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  34.02 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  37.04 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  37.97 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  44.12 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  32.63 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1377  ferredoxin  37.5 
 
 
344 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  42.31 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  42.31 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  42.31 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  42.31 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  39.02 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  41.03 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.16 
 
 
349 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  35.05 
 
 
129 aa  57.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  41.03 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.05 
 
 
343 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  34.41 
 
 
94 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.08 
 
 
343 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4338  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  33.77 
 
 
312 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.13 
 
 
338 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  27.27 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  43.08 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  37.66 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  42.42 
 
 
415 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1591  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  31.25 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.71 
 
 
357 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.46 
 
 
358 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.05 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  30.11 
 
 
373 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  35.37 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  32.05 
 
 
312 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0157718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>