More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_26521 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  67.4 
 
 		 461 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  81.1 
 
 		 465 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  80.56 
 
 		 465 aa  686    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26521  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 464 aa  924    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  64.55 
 
 		 459 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  64.33 
 
 		 459 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  53.96 
 
 		 507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  50.88 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  54.12 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  54.12 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  55.17 
 
 		 520 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  58.11 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  53.65 
 
 		 517 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 450 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  51.18 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  51.66 
 
 		 450 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 450 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  47.71 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  47.71 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  48.17 
 
 		 457 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  51.38 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  47.71 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  47.71 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  47.28 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  46.72 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  47.72 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 448 aa  415  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  51.4 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  48.8 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  50.46 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  44.5 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  41.74 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.7 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  48.97 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  51.4 
 
 		 467 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  44.01 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  44.81 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  47.09 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  49.65 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  43.36 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  43.74 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  43.74 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  46.28 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  50.57 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  51.52 
 
 		 455 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  50.8 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  49.29 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  51.03 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  45.27 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  45.27 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  48.38 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  45.16 
 
 		 470 aa  391  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  47.64 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  52.3 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  49.76 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  47.27 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  50.8 
 
 		 452 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  47.39 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  50.8 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  51.05 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  50.82 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 482 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  47.5 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  50.8 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  50.69 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  48.48 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  49.31 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1933  DNA repair protein RadA  52.79 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  50.69 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  44.15 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  50.69 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  50.46 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  45.62 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>