More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_26481 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 326 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  67.09 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  66.35 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  43.17 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  47.35 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  46.42 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  41.67 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  46.98 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  41.35 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  44.55 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  44.48 
 
 		 317 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.55 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  43.26 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  48.39 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  32.8 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  34.25 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  30.39 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  29.57 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  31.9 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  29.28 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.39 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.55 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  39.01 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.97 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.64 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.56 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 320 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.36 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.74 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.82 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  35.39 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.65 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.06 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.34 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30.14 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  27.33 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.44 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.71 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.34 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.81 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  29.95 
 
 		 389 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  31.67 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.69 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  33.71 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  36.06 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  36.06 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  34.58 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  37.95 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.03 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.77 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  26.03 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.03 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  33.08 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  31.8 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  31.78 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  30.34 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  28.78 
 
 		 339 aa  86.3  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.65 
 
 		 520 aa  86.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  30.34 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.09 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  30.34 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  32.98 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  36.08 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  31.63 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.57 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.08 
 
 		 599 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.94 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.28 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  31.8 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.29 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  31.03 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.86 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  35.76 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  26.67 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  32.09 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  26.67 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.8 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.72 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  26.37 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.2 
 
 		 610 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  33.62 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.43 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  29.83 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  29.3 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  29.92 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.72 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  28.5 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.36 
 
 		 644 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.76 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>