More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24601 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  66.99 
 
 		 206 aa  278  6e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  70.62 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  59.79 
 
 		 206 aa  254  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  51.49 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  51.49 
 
 		 202 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  52.53 
 
 		 208 aa  198  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  45.08 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  51.79 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  50.78 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  50.25 
 
 		 213 aa  187  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 		 199 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.17 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 		 202 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 		 202 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  47.15 
 
 		 209 aa  175  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  47.73 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  48.82 
 
 		 207 aa  167  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 191 aa  165  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  50.31 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  47.95 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  47.95 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  47.37 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  48.24 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  48.24 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  48.24 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.47 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  47.37 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.43 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 189 aa  157  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.24 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  39.09 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  39.09 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  45.62 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  35.64 
 
 		 365 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  41.12 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  38.97 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02582  peptidyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00538326  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  36.98 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  43.93 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  43.2 
 
 		 211 aa  140  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 232 aa  140  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  43.2 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0398  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  47.34 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  45.62 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  42.37 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.12 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.97 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  37.11 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 		 189 aa  138  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 189 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  41.54 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  45.96 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  39.77 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  42.44 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2367  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  40.68 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  40.68 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  41.86 
 
 		 202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  45.24 
 
 		 203 aa  134  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>