More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24171 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  100 
 
 
733 aa  1489    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
3145 aa  298  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 
878 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.1 
 
 
810 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 
689 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
681 aa  247  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
637 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
909 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
566 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
767 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 
1827 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 
615 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.83 
 
 
626 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.53 
 
 
626 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  35.66 
 
 
1676 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.87 
 
 
550 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 
614 aa  221  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 
955 aa  220  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.05 
 
 
626 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.61 
 
 
620 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  25.97 
 
 
714 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
614 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.19 
 
 
614 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.19 
 
 
614 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
935 aa  217  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
620 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
602 aa  217  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.04 
 
 
603 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
614 aa  213  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
740 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
714 aa  210  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 
1450 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
639 aa  201  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
612 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.02 
 
 
1694 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.26 
 
 
725 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
688 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
635 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
635 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
611 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
636 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  35.14 
 
 
936 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.94 
 
 
632 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  24.09 
 
 
1077 aa  194  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  33.97 
 
 
837 aa  193  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
578 aa  193  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
1005 aa  193  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  27.08 
 
 
525 aa  191  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
574 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  25.46 
 
 
703 aa  190  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.15 
 
 
1034 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.94 
 
 
1022 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
747 aa  187  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.06 
 
 
764 aa  187  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
583 aa  187  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.23 
 
 
1056 aa  187  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
523 aa  186  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  27.95 
 
 
577 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 
818 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  25.7 
 
 
648 aa  184  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
646 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
1737 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 
1056 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 
988 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
608 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
780 aa  177  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.11 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 
784 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
662 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
649 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
649 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  29.89 
 
 
360 aa  170  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
1276 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 
685 aa  168  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1421 aa  168  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
481 aa  167  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
3172 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
824 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
879 aa  163  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
412 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
1454 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
1451 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.25 
 
 
462 aa  161  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
465 aa  160  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
3301 aa  160  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
762 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.69 
 
 
622 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
592 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
457 aa  158  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 
454 aa  159  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
1038 aa  158  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
595 aa  157  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 
718 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
927 aa  157  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.52 
 
 
875 aa  156  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  26.1 
 
 
653 aa  156  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>