More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23741 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  74.51 
 
 
408 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
417 aa  865    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  81.37 
 
 
408 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  84.8 
 
 
408 aa  728    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  74.45 
 
 
411 aa  651    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  74.26 
 
 
408 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.92 
 
 
411 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.99 
 
 
411 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.99 
 
 
411 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.35 
 
 
411 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.39 
 
 
411 aa  631  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  74.26 
 
 
408 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  72.64 
 
 
411 aa  627  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.6 
 
 
411 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.64 
 
 
408 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.14 
 
 
408 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.63 
 
 
408 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.4 
 
 
408 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  67.66 
 
 
411 aa  592  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.56 
 
 
407 aa  541  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.34 
 
 
531 aa  533  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.76 
 
 
407 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.8 
 
 
410 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.11 
 
 
411 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.11 
 
 
410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.62 
 
 
410 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.37 
 
 
411 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.62 
 
 
410 aa  511  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.39 
 
 
410 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.13 
 
 
410 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.75 
 
 
407 aa  507  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.57 
 
 
409 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.53 
 
 
410 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.35 
 
 
411 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.66 
 
 
409 aa  483  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  56.05 
 
 
408 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.57 
 
 
409 aa  474  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.01 
 
 
404 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.92 
 
 
424 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  48.26 
 
 
402 aa  359  6e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  46.3 
 
 
443 aa  333  3e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.85 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  30.35 
 
 
386 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.84 
 
 
390 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.92 
 
 
387 aa  149  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  30.97 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  30.19 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.7 
 
 
391 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  29.03 
 
 
387 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.1 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.04 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  29.4 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  31.59 
 
 
395 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.71 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.9 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  29.03 
 
 
401 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  28.54 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.17 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.18 
 
 
392 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.39 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  28.91 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  28.61 
 
 
392 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.46 
 
 
389 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  28 
 
 
384 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  28.54 
 
 
382 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  26.92 
 
 
389 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  28.71 
 
 
392 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  28.71 
 
 
392 aa  123  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  28.71 
 
 
392 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  28.71 
 
 
392 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  28.47 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  29.37 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  28.47 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  27.72 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  28.71 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  26.91 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  28.35 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.58 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.8 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  26.93 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  26.32 
 
 
400 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  29.95 
 
 
392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  27.36 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  27.2 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  26.65 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  26.21 
 
 
385 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  26.7 
 
 
407 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  26.7 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  26.7 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.37 
 
 
392 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  27.01 
 
 
403 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.2 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  27.42 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  26.87 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  27.71 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  27.14 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  30.72 
 
 
387 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  26.42 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  27.56 
 
 
382 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  25.8 
 
 
392 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>