More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23691 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  100 
 
 		 304 aa  613  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  70.92 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  62.63 
 
 		 281 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  68.59 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  57.55 
 
 		 276 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.52 
 
 		 281 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  57.04 
 
 		 281 aa  331  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.63 
 
 		 281 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.87 
 
 		 281 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  57.19 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  40.82 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  43.93 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  42.81 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  46.77 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  45.29 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  45.29 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  43.12 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  41.01 
 
 		 276 aa  172  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  42.8 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.37 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  39.57 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.29 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  41.16 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  39.58 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.58 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  38.52 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  42.75 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  38.3 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  37.14 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  40.5 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  42.45 
 
 		 275 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  39.64 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.57 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  39.14 
 
 		 377 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.43 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  41.52 
 
 		 391 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.91 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  34.19 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.08 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.69 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.91 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  39.53 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  39.22 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  37.15 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  35.07 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.49 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  34.89 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  38.38 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  38.87 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.92 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.82 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  38.25 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  43.37 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  37.89 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.82 
 
 		 359 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  34.74 
 
 		 359 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  37.72 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  37.86 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  38.23 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  38.4 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  34.75 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.61 
 
 		 413 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.07 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  38.4 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  39.2 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  36.11 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  37.81 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.48 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  38.4 
 
 		 364 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.6 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  39.2 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  40.8 
 
 		 365 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  39.71 
 
 		 360 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  38.8 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.21 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.98 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  39.2 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  37.92 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.25 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.25 
 
 		 365 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  38.16 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.08 
 
 		 371 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  35.14 
 
 		 278 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  38.11 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  37.45 
 
 		 374 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.75 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  37.23 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  37.46 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  32.04 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  37.1 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  39.02 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.432859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>