More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  71.36 
 
 
220 aa  343  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  73.18 
 
 
220 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  70.45 
 
 
220 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  69.59 
 
 
218 aa  324  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  69.59 
 
 
218 aa  320  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  68.2 
 
 
218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  67.28 
 
 
218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  70.19 
 
 
217 aa  307  9e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  65.38 
 
 
211 aa  291  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  59.72 
 
 
218 aa  258  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  57.08 
 
 
213 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  55.66 
 
 
212 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  55.66 
 
 
212 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  54.25 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  54.29 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  52.78 
 
 
216 aa  227  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  52.13 
 
 
212 aa  224  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  34.92 
 
 
213 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  33.82 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.51 
 
 
213 aa  91.7  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.12 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.62 
 
 
232 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  33.03 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.99 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  40.32 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  27.18 
 
 
828 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  33.14 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  30.96 
 
 
808 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  41.28 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  27.81 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  43.48 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  32.16 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  30.56 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  30.96 
 
 
804 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.82 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.48 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.28 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  26.21 
 
 
843 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  26.21 
 
 
835 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.04 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  26.21 
 
 
835 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.68 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  29.59 
 
 
805 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.3 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  36.84 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  31.66 
 
 
809 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  36.79 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
816 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.73 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  30.81 
 
 
809 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  32.85 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  31.6 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  29.58 
 
 
823 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  31.73 
 
 
241 aa  72  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  37.14 
 
 
219 aa  72  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  33.96 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  26.29 
 
 
818 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  38.6 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  29.44 
 
 
813 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.3 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.6 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  38.89 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  26.53 
 
 
781 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  25 
 
 
807 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  27.04 
 
 
785 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  25 
 
 
806 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  38.89 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  29.29 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  25 
 
 
806 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  30.69 
 
 
806 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.64 
 
 
784 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  21.3 
 
 
833 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  26.56 
 
 
820 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  30.69 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  33.48 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.14 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  26.6 
 
 
816 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 
785 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  24.26 
 
 
806 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  27.09 
 
 
802 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  25 
 
 
808 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.04 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 
804 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  25 
 
 
813 aa  65.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  25.25 
 
 
802 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 
785 aa  65.5  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
825 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  25 
 
 
780 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 
797 aa  65.1  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  37.78 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.78 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  26.2 
 
 
805 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  28.19 
 
 
806 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 
804 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  38.35 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  28.72 
 
 
802 aa  65.1  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  26.56 
 
 
805 aa  64.7  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 
804 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  25.25 
 
 
802 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>