More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23131 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 118 aa  234  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  77.97 
 
 		 118 aa  186  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  82.24 
 
 		 118 aa  180  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  82.52 
 
 		 103 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  70.34 
 
 		 118 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  73.39 
 
 		 118 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  64.41 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  64.41 
 
 		 118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  64.41 
 
 		 118 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  63.56 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  60.71 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  60.71 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  64.15 
 
 		 113 aa  140  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  60.18 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  63.46 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  63.21 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 115 aa  134  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  50 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  51 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  46.67 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  45 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  58.33 
 
 		 80 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  54.17 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  41.9 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  50 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17263  Plastid ribosomal protein L24 large ribosomal subunit  44.76 
 
 		 127 aa  84.3  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00177842  decreased coverage  0.00283524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  42.31 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  40.38 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  41.9 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  40.2 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  40.2 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>