282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22781 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_22781  recombination protein F  100 
 
 		 352 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  71.23 
 
 		 352 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0394  recombination protein F  77.19 
 
 		 364 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1935  recombination protein F  74.64 
 
 		 353 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  65.61 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  65.32 
 
 		 348 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  43.73 
 
 		 371 aa  272  6e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17601  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  44.65 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17801  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  45.27 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  46.22 
 
 		 376 aa  258  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1665  DNA replication and repair protein RecF  46.18 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17641  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  47.17 
 
 		 265 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.674364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  43.5 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  42.74 
 
 		 390 aa  238  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  45.8 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  45.53 
 
 		 377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  42.82 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  42.82 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  37.14 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  36.31 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  35.38 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  35.38 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  35.38 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  33.53 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  34.69 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  35.09 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  35.09 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  35.09 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  34.96 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  33.62 
 
 		 374 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  35.09 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  34.69 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  34.8 
 
 		 375 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  34.5 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  32.34 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  32.34 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  35.28 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.97 
 
 		 386 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  34.06 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  32.83 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.58 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  35.11 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  34.25 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  34.67 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  35 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.99 
 
 		 372 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.92 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  29.33 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  29.33 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  33.42 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  36.45 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  33.98 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.74 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  34.92 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  33.06 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  37.42 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  28.99 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  32.64 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.47 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  31.2 
 
 		 380 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  33.43 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  31.2 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  31.2 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  32.7 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  33.81 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  30.52 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.53 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.12 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.62 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.62 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  32.46 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.57 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  33.14 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  31.61 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.23 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.23 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  34 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  30.75 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.85 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  31.9 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.59 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.69 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  32.82 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.17 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.16 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  33.24 
 
 		 371 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  33.73 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.05 
 
 		 398 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  33.73 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  33.75 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  31.59 
 
 		 385 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  31.43 
 
 		 377 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.53 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  27.3 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.15 
 
 		 390 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.94 
 
 		 379 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  29.75 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  31.05 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>