More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22691 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  100 
 
 		 427 aa  840    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  76.43 
 
 		 412 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  79.55 
 
 		 412 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  65.55 
 
 		 426 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  56.8 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  56.56 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  49.16 
 
 		 423 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  50.36 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  51.29 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  51.41 
 
 		 422 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  51.47 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  49.04 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  47.47 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  48.67 
 
 		 437 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  48.72 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  48.72 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  47.12 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  48.92 
 
 		 426 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.25 
 
 		 380 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  39.72 
 
 		 387 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  35.18 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.07 
 
 		 379 aa  216  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 		 368 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.84 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.84 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  36.57 
 
 		 389 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 366 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  32.03 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  32.92 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.94 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.34 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  38.15 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  37.06 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  38.55 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  30.43 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.18 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  36.87 
 
 		 386 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  31.58 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  33.91 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  33.25 
 
 		 365 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  38.22 
 
 		 373 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  36.18 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 		 369 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  35.86 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  33.79 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  34.15 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  31.51 
 
 		 364 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  33.33 
 
 		 405 aa  193  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  34.68 
 
 		 385 aa  193  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.59 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  34.56 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  38.04 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  34.61 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  37.86 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  30.2 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  34.3 
 
 		 371 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  32.91 
 
 		 433 aa  189  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.6 
 
 		 371 aa  189  9e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  33.77 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  29.85 
 
 		 371 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  36.9 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  31.55 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  31.25 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  36.72 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  31.55 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  32.62 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  34.58 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  31.71 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  30.45 
 
 		 368 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  32.32 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  38.41 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  35.34 
 
 		 360 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 372 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  32.51 
 
 		 367 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  32.68 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  30.24 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  33.05 
 
 		 373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2191  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>