227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22631 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  73.33 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  76.22 
 
 		 214 aa  292  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  63.08 
 
 		 214 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  62.56 
 
 		 214 aa  257  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  63.49 
 
 		 214 aa  254  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  62.64 
 
 		 209 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  58.43 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  60.23 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  60.57 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  60.57 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  54.05 
 
 		 211 aa  217  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  60.57 
 
 		 209 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  52.97 
 
 		 211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  59.12 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  49.21 
 
 		 213 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  52.43 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  57.14 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  53.59 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  52.98 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  51.93 
 
 		 204 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  52.47 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  48.09 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  51.85 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  50.29 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  52.26 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  45.45 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  48.35 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  51.3 
 
 		 204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  50.31 
 
 		 204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  50.32 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  51.38 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  48.37 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  46.63 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  44.39 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  46.71 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  47.25 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  45.45 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  47.4 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  48.82 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  47.88 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  48.85 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  45.86 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  48.82 
 
 		 205 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  48.24 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  44.44 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  50.3 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  49.68 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  45.83 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  44.51 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  48.72 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  48.07 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  48.08 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  46.37 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  50.94 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  46.71 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  50.71 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  44.24 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  49.03 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  32.09 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  32.97 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  27.96 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  27.96 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  29.89 
 
 		 381 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  32.43 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0668  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.562548  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  36.84 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  29.79 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  33.11 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  32.93 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  34.23 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  33.75 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.89 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  31.85 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  33.33 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  35.64 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  28.9 
 
 		 409 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.35 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  33.97 
 
 		 392 aa  64.7  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  34.55 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  35.11 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  30.63 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  32.1 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  33.54 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  28.8 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  31.29 
 
 		 395 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  33.33 
 
 		 427 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.8 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  32.53 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  31.21 
 
 		 395 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  29.76 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  32.45 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  35.66 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  31.45 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  29.78 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>