More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22481 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  55 
 
 
196 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  54.23 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  57.48 
 
 
157 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  60.18 
 
 
162 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  58.82 
 
 
358 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  65.31 
 
 
335 aa  131  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  69.23 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.64 
 
 
324 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  58.76 
 
 
360 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  58.76 
 
 
360 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  56.78 
 
 
342 aa  121  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.9 
 
 
239 aa  118  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  64.13 
 
 
125 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  58.41 
 
 
371 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  64.13 
 
 
125 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  58 
 
 
121 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
163 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  54.9 
 
 
279 aa  115  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  56.44 
 
 
139 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
119 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
124 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
163 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  54.7 
 
 
134 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  57 
 
 
121 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  50.88 
 
 
238 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  60.42 
 
 
115 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  50.93 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  60.42 
 
 
115 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
124 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
124 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  51.96 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  59.38 
 
 
115 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  55.88 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  38.6 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  51.96 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
122 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.61 
 
 
243 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
124 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
121 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
145 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
171 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
155 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  54.84 
 
 
122 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  51 
 
 
153 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  54.35 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  54.35 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  54.35 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
142 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  54.35 
 
 
230 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  54.35 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
170 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  54.35 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
262 aa  107  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
321 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  54.35 
 
 
230 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  54.35 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
206 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
246 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
122 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
206 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  43.86 
 
 
167 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
124 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  51.46 
 
 
264 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  41.18 
 
 
322 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
120 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  43.41 
 
 
254 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
124 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
339 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  43.97 
 
 
127 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
168 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
186 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
217 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  54.26 
 
 
165 aa  104  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
140 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
323 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  46.74 
 
 
293 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
128 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
168 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
227 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  47.87 
 
 
263 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
260 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  50 
 
 
342 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  50 
 
 
342 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
150 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  43.41 
 
 
259 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  51.43 
 
 
322 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
120 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
212 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
160 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  53.47 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  51.49 
 
 
120 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  49.45 
 
 
267 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>