More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  100 
 
 		 658 aa  1353    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  63.95 
 
 		 602 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  72.1 
 
 		 692 aa  887    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  69.72 
 
 		 680 aa  915    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  55.46 
 
 		 712 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  48.35 
 
 		 776 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  47.32 
 
 		 755 aa  548  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  47.22 
 
 		 626 aa  531  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  45.76 
 
 		 811 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  46.59 
 
 		 824 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  46.42 
 
 		 824 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  40.71 
 
 		 589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  39.74 
 
 		 589 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  39.89 
 
 		 589 aa  429  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  39.33 
 
 		 589 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  38.12 
 
 		 806 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 		 775 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 		 643 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 		 643 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  38.95 
 
 		 768 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  42.29 
 
 		 732 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.33 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.41 
 
 		 640 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  38.79 
 
 		 712 aa  363  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  40 
 
 		 761 aa  363  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  38.66 
 
 		 718 aa  359  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 718 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  38.55 
 
 		 723 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 724 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  37.84 
 
 		 640 aa  356  6.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  37.33 
 
 		 739 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.6 
 
 		 643 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.62 
 
 		 732 aa  352  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  38.79 
 
 		 742 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  35.49 
 
 		 724 aa  352  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  38.3 
 
 		 727 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  38.13 
 
 		 714 aa  351  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 709 aa  350  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  39.5 
 
 		 709 aa  350  6e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.8 
 
 		 618 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 691 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  37.34 
 
 		 770 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  39.67 
 
 		 751 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.54 
 
 		 751 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.54 
 
 		 751 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.61 
 
 		 751 aa  346  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  38.14 
 
 		 735 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.27 
 
 		 734 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.16 
 
 		 646 aa  344  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 		 654 aa  343  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  38.64 
 
 		 734 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 741 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  38.39 
 
 		 720 aa  342  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  37.54 
 
 		 720 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  39.58 
 
 		 750 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  37.71 
 
 		 714 aa  339  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  36.67 
 
 		 759 aa  339  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.27 
 
 		 905 aa  339  9e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.36 
 
 		 776 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.26 
 
 		 761 aa  339  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  36.07 
 
 		 707 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  39.93 
 
 		 762 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  36.86 
 
 		 625 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  38.07 
 
 		 648 aa  337  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  39.06 
 
 		 757 aa  337  5.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.43 
 
 		 779 aa  336  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  36.47 
 
 		 784 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  36.62 
 
 		 750 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  35.2 
 
 		 757 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39.25 
 
 		 714 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  36.47 
 
 		 765 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  36.47 
 
 		 744 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 654 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  36.3 
 
 		 760 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.8 
 
 		 730 aa  334  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  36.09 
 
 		 759 aa  334  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 669 aa  333  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.65 
 
 		 648 aa  333  7.000000000000001e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.43 
 
 		 763 aa  333  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  36.32 
 
 		 760 aa  333  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  37.56 
 
 		 728 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.89 
 
 		 661 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  38.68 
 
 		 740 aa  332  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  38.32 
 
 		 651 aa  332  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  37.84 
 
 		 833 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 649 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  38.18 
 
 		 727 aa  331  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  37.88 
 
 		 727 aa  331  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 		 828 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  33.83 
 
 		 769 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  36.3 
 
 		 750 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  38.68 
 
 		 712 aa  329  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  38.12 
 
 		 728 aa  329  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  38.21 
 
 		 733 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  35.26 
 
 		 758 aa  328  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  35.09 
 
 		 713 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  35.09 
 
 		 713 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  35.09 
 
 		 713 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  37.17 
 
 		 764 aa  327  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  38.3 
 
 		 756 aa  326  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.879248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>