More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20381 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  73.2 
 
 
334 aa  177  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  49.28 
 
 
233 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  61.16 
 
 
581 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  60.8 
 
 
306 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  49.68 
 
 
582 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  49.68 
 
 
706 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  62.75 
 
 
306 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  56.77 
 
 
462 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  48.39 
 
 
706 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  59.29 
 
 
539 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  42.68 
 
 
202 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.58 
 
 
406 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.58 
 
 
406 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.73 
 
 
542 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.61 
 
 
308 aa  100  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  44.55 
 
 
446 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  35.93 
 
 
205 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  42.24 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 
428 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  45.87 
 
 
243 aa  97.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  45.3 
 
 
331 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  48.45 
 
 
404 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
284 aa  93.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.34 
 
 
373 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  48.42 
 
 
280 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
191 aa  91.7  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 
308 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 
361 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.83 
 
 
471 aa  90.9  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  40.77 
 
 
442 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
547 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
260 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.14 
 
 
261 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  40.94 
 
 
605 aa  88.2  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  53.09 
 
 
352 aa  87.4  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.12 
 
 
248 aa  87  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.83 
 
 
249 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.74 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.83 
 
 
249 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
349 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.74 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  44.09 
 
 
371 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 
219 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.37 
 
 
357 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 
1421 aa  84.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
205 aa  84.3  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.18 
 
 
778 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 
649 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  48.81 
 
 
271 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  43.27 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  44 
 
 
297 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.14 
 
 
818 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.4 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.07 
 
 
1022 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 
306 aa  81.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
515 aa  80.9  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.57 
 
 
458 aa  80.5  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.16 
 
 
784 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  46.32 
 
 
617 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.45 
 
 
927 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  41.51 
 
 
541 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  36.27 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41 
 
 
746 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 
392 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 
422 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  36.21 
 
 
1240 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.47 
 
 
343 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.57 
 
 
988 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.15 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3390  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40 
 
 
738 aa  77.4  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.28 
 
 
820 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.28 
 
 
1056 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.89 
 
 
1056 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  44.21 
 
 
878 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 
1276 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.7 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.37 
 
 
632 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 
279 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  41.41 
 
 
391 aa  74.3  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
246 aa  73.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  45.12 
 
 
556 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  36.75 
 
 
750 aa  73.2  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  37.96 
 
 
725 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
3035 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
499 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  39.05 
 
 
425 aa  71.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 
425 aa  71.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 
389 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  38.6 
 
 
715 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>