More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17611 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  100 
 
 
227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  60.45 
 
 
221 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  61.01 
 
 
222 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  60.55 
 
 
222 aa  278  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  64.71 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  55.45 
 
 
219 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  55.91 
 
 
219 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  56.36 
 
 
219 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  55.91 
 
 
219 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  56.89 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.95 
 
 
219 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
227 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  42.58 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.59 
 
 
218 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  38.1 
 
 
209 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
209 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  33.65 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
219 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.74 
 
 
257 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.43 
 
 
257 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.43 
 
 
257 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.8 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  33.33 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  32.44 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  33.97 
 
 
232 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30.33 
 
 
232 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  32.88 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  33.33 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  29.95 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  27.91 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  29.17 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  26.89 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.54 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  31.22 
 
 
339 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  29.82 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.22 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  27.73 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  31.25 
 
 
224 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  28.11 
 
 
372 aa  61.6  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.67 
 
 
320 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.89 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  27.54 
 
 
366 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  26.84 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.33 
 
 
320 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  28.92 
 
 
294 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  32.35 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  27.83 
 
 
282 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  27.03 
 
 
210 aa  58.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.81 
 
 
320 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  38.46 
 
 
126 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
350 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  27.5 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.73 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.52 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.03 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  32.52 
 
 
312 aa  56.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  23.64 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.79 
 
 
320 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  30.49 
 
 
214 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.6 
 
 
324 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  29.15 
 
 
209 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.12 
 
 
324 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  33.55 
 
 
323 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  33.55 
 
 
323 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  28.06 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>