More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16761 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  54.25 
 
 
607 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  57.58 
 
 
614 aa  712    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  100 
 
 
600 aa  1218    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  59.08 
 
 
598 aa  711    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  56.57 
 
 
614 aa  701    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  53.58 
 
 
599 aa  642    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  56.5 
 
 
615 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  55.65 
 
 
602 aa  681    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  84.56 
 
 
598 aa  1061    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  54.94 
 
 
606 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  57.48 
 
 
614 aa  706    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  53.6 
 
 
600 aa  661    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  54.28 
 
 
602 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  55.46 
 
 
613 aa  687    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  53.33 
 
 
610 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  54.87 
 
 
603 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  53.85 
 
 
607 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  57.48 
 
 
614 aa  706    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  57.48 
 
 
614 aa  706    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  57.07 
 
 
614 aa  705    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 
608 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  54.84 
 
 
608 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  54.84 
 
 
608 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  57 
 
 
599 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  57.53 
 
 
627 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 
613 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  56.08 
 
 
615 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  84.4 
 
 
598 aa  1057    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  54.68 
 
 
606 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  56.32 
 
 
610 aa  687    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  60.1 
 
 
614 aa  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  75.89 
 
 
596 aa  943    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 
608 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 
607 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  84.64 
 
 
599 aa  1059    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 
608 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  59.08 
 
 
602 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 
608 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 
610 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  90.83 
 
 
600 aa  1131    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 
608 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  90.15 
 
 
602 aa  1124    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  58.05 
 
 
598 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 
608 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  57.48 
 
 
614 aa  706    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  54.11 
 
 
600 aa  663    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  82.05 
 
 
598 aa  1035    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  78.75 
 
 
597 aa  967    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 
603 aa  687    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 
592 aa  680    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 
608 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  53.24 
 
 
615 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 
608 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  81.54 
 
 
598 aa  1032    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  82.2 
 
 
600 aa  1021    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 
609 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  53 
 
 
605 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 
608 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 
608 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  57.75 
 
 
602 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 
603 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
608 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
603 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 
609 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 
609 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  54.28 
 
 
602 aa  664    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 
609 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 
602 aa  664    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  53.18 
 
 
605 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  57.98 
 
 
593 aa  670    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  57.41 
 
 
614 aa  702    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  81.71 
 
 
598 aa  1032    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 
608 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  52.27 
 
 
623 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  56.08 
 
 
615 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  57.53 
 
 
613 aa  668    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  56.05 
 
 
610 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  56.39 
 
 
610 aa  665    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 
608 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  77.57 
 
 
596 aa  971    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  55.04 
 
 
603 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  55.04 
 
 
603 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  55.89 
 
 
602 aa  661    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 
603 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 
608 aa  655    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 
608 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 
603 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  55.37 
 
 
613 aa  666    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0807  stress response membrane GTPase  54.01 
 
 
611 aa  684    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0319085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  55.54 
 
 
618 aa  685    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1342  stress response membrane GTPase  55.57 
 
 
613 aa  684    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0910775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  55.22 
 
 
615 aa  676    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 
608 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  76.39 
 
 
596 aa  943    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  53.7 
 
 
608 aa  651    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 
603 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  54.45 
 
 
602 aa  665    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  57.02 
 
 
601 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  54.07 
 
 
608 aa  641    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 
608 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>