263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16721 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_07951  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  52.16 
 
 
720 aa  754    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0163  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.29 
 
 
720 aa  746    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1241  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  58.97 
 
 
720 aa  802    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.232901  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1228  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  58.97 
 
 
723 aa  774    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.315931 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10041  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  55.83 
 
 
720 aa  826    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215358  normal  0.629602 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16721  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  100 
 
 
721 aa  1434    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08241  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  39.58 
 
 
719 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0767  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.31 
 
 
720 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00745719  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08211  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  40.45 
 
 
720 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.938458  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.58 
 
 
728 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08191  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  40.22 
 
 
720 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.77 
 
 
719 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.51 
 
 
716 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.56 
 
 
711 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.56 
 
 
711 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.54 
 
 
717 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.43 
 
 
733 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.81 
 
 
731 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.24 
 
 
687 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.89 
 
 
698 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.07 
 
 
694 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.63 
 
 
693 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  36.24 
 
 
690 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  37.03 
 
 
695 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.81 
 
 
687 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.39 
 
 
688 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 
687 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.71 
 
 
686 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.07 
 
 
691 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.67 
 
 
686 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.98 
 
 
690 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.63 
 
 
690 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.68 
 
 
691 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  36.1 
 
 
688 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  34.85 
 
 
729 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.17 
 
 
678 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.43 
 
 
687 aa  356  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  34.81 
 
 
688 aa  353  5.9999999999999994e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  35.8 
 
 
693 aa  353  7e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.49 
 
 
690 aa  352  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.06 
 
 
680 aa  350  5e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.79 
 
 
673 aa  350  6e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  34.93 
 
 
700 aa  350  6e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.54 
 
 
679 aa  348  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  35.27 
 
 
696 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.06 
 
 
688 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.43 
 
 
687 aa  347  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.05 
 
 
694 aa  347  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.05 
 
 
694 aa  347  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.98 
 
 
694 aa  346  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.5 
 
 
705 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.7 
 
 
685 aa  345  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.08 
 
 
690 aa  344  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.18 
 
 
701 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.52 
 
 
695 aa  340  5e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.31 
 
 
684 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.47 
 
 
697 aa  340  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.76 
 
 
683 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.73 
 
 
688 aa  339  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  35.64 
 
 
991 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.99 
 
 
701 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.17 
 
 
684 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.98 
 
 
683 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2459  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.67 
 
 
697 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.66 
 
 
689 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.66 
 
 
689 aa  335  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.66 
 
 
689 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.44 
 
 
701 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.93 
 
 
684 aa  334  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.93 
 
 
692 aa  334  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.49 
 
 
689 aa  334  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.44 
 
 
693 aa  334  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.44 
 
 
684 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.31 
 
 
702 aa  333  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.07 
 
 
696 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.66 
 
 
689 aa  332  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.03 
 
 
668 aa  331  3e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.3 
 
 
684 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.81 
 
 
684 aa  330  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4496  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.59 
 
 
993 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.957039 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.44 
 
 
689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.29 
 
 
693 aa  328  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.25 
 
 
685 aa  327  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.38 
 
 
692 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.03 
 
 
689 aa  324  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  34.44 
 
 
691 aa  324  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.06 
 
 
689 aa  323  5e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.04 
 
 
688 aa  323  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.5 
 
 
688 aa  323  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  33.01 
 
 
688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.86 
 
 
689 aa  321  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.25 
 
 
685 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.47 
 
 
696 aa  319  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.92 
 
 
689 aa  318  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.78 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.78 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.78 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.48 
 
 
692 aa  317  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.64 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.78 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>