More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16591 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  100 
 
 		 294 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  57.53 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  60.78 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  59.25 
 
 		 298 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  58.37 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  57.59 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  52.92 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  50.39 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  50.19 
 
 		 304 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  49.61 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  33.04 
 
 		 366 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  29.31 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  28.49 
 
 		 400 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  31.07 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  27.32 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  39.72 
 
 		 438 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  39.72 
 
 		 438 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  28.88 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  34.02 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  36.54 
 
 		 399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  29.57 
 
 		 414 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  26.83 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  36.76 
 
 		 479 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  40.16 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  32.51 
 
 		 474 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  33.33 
 
 		 434 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  26.3 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  39.5 
 
 		 406 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  32.28 
 
 		 428 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  27.93 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  31.5 
 
 		 607 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  29.44 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  25.43 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.57 
 
 		 405 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  29.67 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  26.41 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.41 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.78 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  30.41 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  29.82 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  27.14 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  26.63 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  25.44 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  23.59 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  26.63 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.9 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  25.7 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  28.87 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.87 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.21 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  25.73 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  29.27 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  25.73 
 
 		 338 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  25.94 
 
 		 352 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  25.85 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  28.45 
 
 		 396 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  30.57 
 
 		 391 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  31.69 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  23.86 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  29.69 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  23.86 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  25.38 
 
 		 405 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3720  RND family efflux pump membrane fusion protein  31.16 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0718738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  30.1 
 
 		 445 aa  55.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 		 405 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  21.67 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  23.28 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 424 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 438 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  30.08 
 
 		 455 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  22.99 
 
 		 417 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.92 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  29.38 
 
 		 504 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.54 
 
 		 392 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 410 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  26.32 
 
 		 378 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 414 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3340  secretion protein HlyD family protein  28.81 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.61 
 
 		 379 aa  52.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  23.93 
 
 		 353 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 500 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  24.41 
 
 		 394 aa  52.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>