270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16131 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 
310 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  31.42 
 
 
290 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0490  hypothetical protein  36.3 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  27.84 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.3 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  30.2 
 
 
311 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  28.81 
 
 
314 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
307 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26 
 
 
302 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  31.37 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  29.52 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  29 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  32.11 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.37 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  30.91 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.39 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  31.75 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  28.57 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  27.99 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.11 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  23.26 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  25.85 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  26.43 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  27.97 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  28.89 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  29.58 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  26.74 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  26.32 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  25.76 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  28.47 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.31 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.52 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  26.52 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  28.09 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  28.32 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  23.49 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  24.83 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  25.43 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  27.72 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  25.33 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  30.6 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4412  hypothetical protein  25.34 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498323  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.74 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  23.59 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  25.29 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  26.37 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0570975  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  25.09 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.02 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  29.82 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.71 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  28.41 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  27.31 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  25.67 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 
283 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  25.91 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  25.98 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  26.07 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  28.32 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  24.38 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  27.12 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  21.45 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  28.19 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  28.19 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  27.8 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  25.43 
 
 
296 aa  59.7  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  28.19 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  28.57 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  27.37 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>