41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16011 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  310  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  41.3 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.13 
 
 
137 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.1 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.73 
 
 
193 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.26 
 
 
142 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.87 
 
 
150 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 
178 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  39.62 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  30.72 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.87 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  35.9 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  34.78 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.77 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  33.03 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  33.03 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  27.97 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  30.63 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  30.63 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.68 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.43 
 
 
231 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  28.7 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  30.43 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  30.43 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  32.89 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  29.91 
 
 
140 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  29.31 
 
 
142 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.81 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  26.5 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  28.95 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  28.95 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  26.61 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  26.09 
 
 
146 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  26.09 
 
 
146 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.49 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>