181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  76.09 
 
 
98 aa  137  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  76.09 
 
 
98 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  56.57 
 
 
102 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  55.1 
 
 
100 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  55.1 
 
 
100 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  51.09 
 
 
92 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  52.87 
 
 
92 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  52.87 
 
 
92 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  51.72 
 
 
92 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  55.42 
 
 
98 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  49.44 
 
 
92 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  50.62 
 
 
92 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  46.34 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  46.32 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  50 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  45.95 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  52.38 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  52.38 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  48.19 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  50 
 
 
76 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  50.75 
 
 
237 aa  67.4  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  42.68 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  41.43 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  42.68 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  42.68 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  42.67 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  42.67 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  42.67 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  42.67 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  42.67 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  42.67 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  42.67 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
87 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  35.11 
 
 
199 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  38.03 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  49.32 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 
192 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  37.04 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  36.14 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  37.93 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  31.08 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  35.71 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  37.33 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 
184 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  34.94 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  35.9 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  40.26 
 
 
196 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  40 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  39.76 
 
 
197 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  40.26 
 
 
196 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  34.67 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  32.1 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  35.29 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  29.9 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  38.55 
 
 
197 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 
196 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  34.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  34.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  34.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  34.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  40.3 
 
 
196 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  28.4 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  39.71 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  37.68 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  34.18 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  30 
 
 
101 aa  48.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  35.48 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 
94 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  37.66 
 
 
196 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  36.17 
 
 
92 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  36.17 
 
 
92 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>