More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14741 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0342  methionyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 516 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.190132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1140  methionyl-tRNA synthetase  70.82 
 
 		 514 aa  759    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.266684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1334  methionyl-tRNA synthetase  70.23 
 
 		 514 aa  762    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0404003 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10151  methionyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 		 516 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145983 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14741  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 515 aa  1073    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0426231 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08971  methionyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 		 509 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.931117  decreased coverage  0.000000449236 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09951  methionyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09481  methionyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 511 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09931  methionyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 514 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0902215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0934  methionyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 511 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 533 aa  556  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 530 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 530 aa  551  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 530 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 535 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 535 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 531 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 510 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 509 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 509 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 650 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 648 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 632 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 654 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 655 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 526 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 645 aa  424  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 653 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 651 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 650 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 629 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 519 aa  417  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 629 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 647 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 660 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 660 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 653 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 660 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 645 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 526 aa  412  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 516 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 518 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 660 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 638 aa  412  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 660 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 660 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 660 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 660 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 515 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 515 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 647 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 659 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 525 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 523 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 650 aa  395  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 628 aa  395  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5259  methionyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 675 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 666 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 681 aa  391  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 648 aa  388  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 671 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  39.58 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 665 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 544 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>