More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_11141 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  50.31 
 
 
368 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  47.45 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  44.12 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  43.05 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  39.68 
 
 
317 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.67 
 
 
309 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.58 
 
 
318 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 
302 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 
314 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 
328 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 
307 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 
317 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.64 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  32.69 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.48 
 
 
316 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 
296 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.48 
 
 
316 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.04 
 
 
514 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 
282 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 
300 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.23 
 
 
290 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.48 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.83 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.48 
 
 
316 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.83 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.51 
 
 
316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  30.92 
 
 
344 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.71 
 
 
349 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.52 
 
 
323 aa  136  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.51 
 
 
316 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.62 
 
 
290 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 
310 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  29.83 
 
 
333 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 
310 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  24.29 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  24.29 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.55 
 
 
326 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 
310 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  25.68 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.21 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
312 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 
303 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  27.66 
 
 
294 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  29.15 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 
295 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 
293 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  23.85 
 
 
328 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 
336 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 
308 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  31.88 
 
 
506 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 
285 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 
312 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  29.46 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.8 
 
 
298 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.11 
 
 
298 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  30.4 
 
 
309 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  28.36 
 
 
307 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.44 
 
 
320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  27.61 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 
292 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 
323 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 
311 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  28.38 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  29.23 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  28.57 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  25.96 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  27.95 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 
316 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  27.45 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  28.29 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 
305 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.88 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.8 
 
 
311 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  25.55 
 
 
296 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  25.48 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  27.9 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.91 
 
 
305 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>