49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_10991 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  303  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  43.7 
 
 
143 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  43.7 
 
 
143 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  37.78 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  39.83 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.39 
 
 
178 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  35 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  35 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  30.72 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  34.62 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  33.1 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  33.65 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  28.99 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.62 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  35.71 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  33.61 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  34.27 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.81 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.91 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  24.31 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  26.76 
 
 
141 aa  59.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  29.2 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  26.83 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  39.47 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0831  hypothetical protein  31.03 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  28.83 
 
 
141 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.91 
 
 
231 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  26.4 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  31.4 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  32.99 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  24.77 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 
147 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.23 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 
134 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  37.5 
 
 
138 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>