More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_10401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_10401  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  33.33 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.55 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  34.13 
 
 
219 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  31.68 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34 
 
 
213 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  32.04 
 
 
220 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.12 
 
 
212 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  36.6 
 
 
210 aa  106  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  28.64 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  28.64 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  28.64 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  28.64 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  28.64 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  28.64 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  28.64 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  28.64 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 
213 aa  104  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.14 
 
 
213 aa  104  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 
213 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.19 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 
212 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  30 
 
 
214 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  29.21 
 
 
214 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  101  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.44 
 
 
208 aa  101  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  32.32 
 
 
203 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  29.21 
 
 
214 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.11 
 
 
206 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  29.21 
 
 
214 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  29.21 
 
 
214 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  29.7 
 
 
215 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  26.53 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.25 
 
 
213 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.3 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.3 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.83 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.3 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.3 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.84 
 
 
206 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  27.45 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  27.78 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.64 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.94 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.37 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.37 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  28.22 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  28.28 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  28.28 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  28.28 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  28.28 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  28.28 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  28.22 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.22 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  28.22 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  28.22 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  28.22 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  28.22 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  28.22 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  28.22 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.22 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.37 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  26.09 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  27.54 
 
 
212 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.5 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.49 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.04 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.6 
 
 
207 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 
211 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.78 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  27.27 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.73 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  26.87 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.62 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  29.15 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  30.61 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.64 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  28.79 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0155  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.47 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  26.77 
 
 
210 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  27.36 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  27.36 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.02 
 
 
217 aa  89  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1394  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.38 
 
 
236 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.38 
 
 
236 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.38 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  27.36 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.18 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.61 
 
 
214 aa  88.2  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  26.87 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.57 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.08 
 
 
217 aa  87.8  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  29.79 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  26.87 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  26.87 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>