More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_10011 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  71.09 
 
 		 520 aa  798    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  62.6 
 
 		 506 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  65.61 
 
 		 512 aa  715    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  79.53 
 
 		 518 aa  873    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  79.77 
 
 		 518 aa  873    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  66.28 
 
 		 514 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  66.4 
 
 		 504 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  64.74 
 
 		 508 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  65.42 
 
 		 512 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  63.96 
 
 		 532 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  74.36 
 
 		 516 aa  828    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  66.4 
 
 		 514 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  66.6 
 
 		 514 aa  732    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  64.64 
 
 		 514 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  71.34 
 
 		 520 aa  800    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  100 
 
 		 520 aa  1077    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  66.4 
 
 		 506 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  43.75 
 
 		 507 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  42.75 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  43.37 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  42.38 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  43.37 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  39.76 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 502 aa  282  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  34.87 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 497 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 497 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 515 aa  253  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  29.92 
 
 		 938 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 512 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  32.09 
 
 		 512 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  30.37 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  30.37 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  33.73 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  29.49 
 
 		 509 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  29.38 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  29.3 
 
 		 509 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  29.09 
 
 		 554 aa  197  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  32 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  33.06 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  29.61 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  28.48 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  28.6 
 
 		 595 aa  191  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  30.48 
 
 		 633 aa  186  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  28.49 
 
 		 598 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  28.79 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  29.45 
 
 		 645 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  28.6 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.04 
 
 		 499 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.49 
 
 		 499 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.26 
 
 		 523 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  27.56 
 
 		 505 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  27.13 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  27.47 
 
 		 510 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  29.15 
 
 		 708 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 717 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  26.6 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.61 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  29.08 
 
 		 544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  27.77 
 
 		 635 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  28.16 
 
 		 711 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23 
 
 		 740 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  27.64 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.1 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.44 
 
 		 549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  25.22 
 
 		 546 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  23.55 
 
 		 501 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  25.31 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  24.66 
 
 		 518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 547 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 722 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  24.18 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  23.84 
 
 		 474 aa  115  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  25.14 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  24.67 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.86 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.21 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  23.61 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.58 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  26.01 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  23.54 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  25.15 
 
 		 505 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.88 
 
 		 511 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.92 
 
 		 511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  24.08 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.76 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  24.75 
 
 		 505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  23.71 
 
 		 501 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  24.85 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  23.3 
 
 		 503 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>