More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08701 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  100 
 
 
392 aa  793  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  54.6 
 
 
357 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  62.87 
 
 
417 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  53.57 
 
 
357 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  61.18 
 
 
388 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  50 
 
 
356 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  42.11 
 
 
353 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  41.83 
 
 
353 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  42.11 
 
 
353 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  41.87 
 
 
353 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37 
 
 
432 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 
490 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  57.37 
 
 
450 aa  184  2e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  29.91 
 
 
500 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.37 
 
 
504 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.45 
 
 
487 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.8 
 
 
487 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  45.21 
 
 
489 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  34.33 
 
 
517 aa  147  2e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.48 
 
 
405 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  31.46 
 
 
394 aa  119  1e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  30 
 
 
402 aa  118  2e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.48 
 
 
404 aa  115  2e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  28.42 
 
 
323 aa  115  2e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.33 
 
 
400 aa  115  2e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 
401 aa  112  1e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  6.83509e-09 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 
401 aa  112  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 
450 aa  111  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 
401 aa  111  2e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  7.66037e-07 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.53 
 
 
408 aa  111  2e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.53 
 
 
408 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 
453 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.33 
 
 
407 aa  109  8e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  24.68 
 
 
451 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.25 
 
 
404 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 
405 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  31.02 
 
 
401 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 
322 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  31.33 
 
 
401 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  31.33 
 
 
401 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 
471 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 
409 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 
465 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 
442 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 
415 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 
432 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.68 
 
 
428 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 
432 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 
322 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 
429 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 
455 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  26.26 
 
 
407 aa  102  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  28.79 
 
 
400 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  unclonable  1.00142e-11 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 
390 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.82 
 
 
403 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.67095e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 
419 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  31.54 
 
 
406 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  26.35 
 
 
360 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  30.18 
 
 
404 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.98894e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 
326 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 
419 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 
377 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 
417 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.83 
 
 
429 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.11 
 
 
373 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  28.8 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  3.06136e-07  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  31.64 
 
 
425 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  24.4 
 
 
324 aa  97.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  24.82 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.24 
 
 
376 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.16 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  29.15 
 
 
458 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 
453 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.62 
 
 
509 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05818e-10 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  26.22 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.72 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.32 
 
 
466 aa  94  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 
405 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 
416 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>