More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08511 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  100 
 
 		 320 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  73.44 
 
 		 320 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  72.5 
 
 		 320 aa  497  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  71.56 
 
 		 320 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  66.88 
 
 		 324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  66.56 
 
 		 324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  63.75 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  61.56 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  62.5 
 
 		 320 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  62.19 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  51.1 
 
 		 332 aa  352  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  51.56 
 
 		 320 aa  351  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  52.92 
 
 		 339 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  52.77 
 
 		 323 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  52.77 
 
 		 323 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  50.16 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  50.81 
 
 		 328 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  49.23 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  41.01 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  32.39 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.73 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  28.24 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  26.59 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  38.67 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.63 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.43 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.57 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.57 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  28.77 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  25.73 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  30.37 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  26.41 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  25.86 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.44 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  29.8 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  28.77 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  27.98 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.06 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  26.58 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  26.79 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  27.4 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.85 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  26.61 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  26.13 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.02 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  29.5 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.52 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  27.19 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  34.75 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  28.11 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  29.6 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  27.11 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  25.35 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  28.57 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  24.35 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  28.5 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.29 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.34 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  28.94 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  31.61 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  28.4 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.38 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  28.26 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  24.83 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.28 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  26.91 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.25 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.5 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  32.14 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  26.89 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  29.41 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  29.03 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.77 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  27.48 
 
 		 254 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.8 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>