More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_07601 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  100 
 
 		 375 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  65.6 
 
 		 375 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  68.63 
 
 		 377 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  59.31 
 
 		 376 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  69.79 
 
 		 381 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  59.47 
 
 		 376 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  48.39 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  46.4 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  47.3 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  47.06 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  44.99 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  35.97 
 
 		 370 aa  273  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  37.77 
 
 		 373 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  36.96 
 
 		 373 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  35.33 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  37.6 
 
 		 374 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  34.88 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.68 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.82 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.68 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  30.28 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.62 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.05 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.72 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  26.57 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.53 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  29.6 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  26.57 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  26.57 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.2 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  26.57 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  26.57 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  28.03 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  28.03 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  28.03 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.57 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  28.03 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  28.99 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.7 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  21.54 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.71 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  29.35 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  29.35 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  29.35 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  29.35 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  29.35 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  29.35 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  28.39 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>