More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_07411 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  100 
 
 		 342 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  73.62 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  74.77 
 
 		 337 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  63.41 
 
 		 348 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  58.95 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  58.64 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  53.57 
 
 		 407 aa  364  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  47.69 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  49.39 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  49.69 
 
 		 333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  48.77 
 
 		 334 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  53.48 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  51.06 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  51.74 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  51.74 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  51.85 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  52.04 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  52.48 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  53.12 
 
 		 333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  51.7 
 
 		 335 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  51.26 
 
 		 331 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  49.23 
 
 		 330 aa  338  9e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  51.1 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  53.29 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  49.85 
 
 		 332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  50.15 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  52.66 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  49.69 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  49.39 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  51.23 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  51.58 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  48.3 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  49.24 
 
 		 333 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  49.39 
 
 		 337 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  47.88 
 
 		 337 aa  315  9e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  47.88 
 
 		 337 aa  315  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  48.16 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  49.54 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  48.62 
 
 		 331 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  48.48 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  48.61 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  48.3 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  47.37 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  50.16 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  47.09 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.01 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  41.98 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  43.75 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  40.19 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  41.64 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.95 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  37.03 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  36.62 
 
 		 328 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.19 
 
 		 328 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  35.89 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  34.17 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  33.64 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  33.63 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.02 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.81 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.11 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  30.08 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.77 
 
 		 297 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.52 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  27.4 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.42 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  27.21 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.32 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  27.4 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.07 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.92 
 
 		 308 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.41 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.02 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  30.34 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.32 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  29.66 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  28.48 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  24.44 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.58 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  24.35 
 
 		 645 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.95 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.29 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  28.3 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.29 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  22.93 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000207  inosine-guanosine kinase  27.75 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.471058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  29.59 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>