228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06941 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
176 aa  349  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  87.73 
 
 
165 aa  288  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1708  putative nucleotide-binding protein  87.12 
 
 
165 aa  283  8e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04811  putative nucleotide-binding protein  69.94 
 
 
165 aa  244  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05371  putative nucleotide-binding protein  67.48 
 
 
165 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.280334 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1813  putative nucleotide-binding protein  66.87 
 
 
165 aa  229  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0232218  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05441  putative nucleotide-binding protein  58.02 
 
 
165 aa  201  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.519943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  55.49 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05361  putative nucleotide-binding protein  56.17 
 
 
165 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05061  putative nucleotide-binding protein  54.94 
 
 
165 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0481  putative nucleotide-binding protein  54.32 
 
 
165 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  57.67 
 
 
163 aa  192  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
163 aa  189  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 
163 aa  189  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  54.6 
 
 
165 aa  187  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  58.18 
 
 
163 aa  185  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  53.99 
 
 
165 aa  184  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  52.5 
 
 
165 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
162 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  43.12 
 
 
164 aa  127  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  46.71 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  43.37 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  40.37 
 
 
166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  124  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
162 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  37.8 
 
 
164 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  43.03 
 
 
162 aa  122  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
161 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  43.98 
 
 
163 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  43.37 
 
 
163 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
161 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
161 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
165 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  44.24 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  43.98 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  44.58 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
161 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
162 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  45.06 
 
 
165 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  37.5 
 
 
160 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  38.55 
 
 
164 aa  117  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  42.17 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  38.51 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  39.75 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  43.21 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  40.96 
 
 
163 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
163 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
165 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  42.17 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  40.37 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
163 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  37.04 
 
 
163 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  38.89 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>