41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06391 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  242  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  82.91 
 
 
118 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  82.91 
 
 
118 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  78.15 
 
 
120 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  70.69 
 
 
117 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  68.97 
 
 
117 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  69.83 
 
 
117 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  73.55 
 
 
123 aa  170  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  74.38 
 
 
138 aa  170  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  68.97 
 
 
117 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  46.15 
 
 
129 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  46.73 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  39.52 
 
 
122 aa  87.4  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  42.15 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  42.15 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  42.74 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  42.37 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  43.1 
 
 
129 aa  84  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  41.53 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  40.52 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  42.99 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  40.68 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  42.74 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  39.83 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  39.67 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  39.32 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  39.17 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  43.27 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  45.28 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  41.12 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  41.46 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  41.12 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  43.4 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  41.46 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  42.06 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  41.35 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  41.35 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  41.03 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  41.35 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  40.19 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  39.67 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>