More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06261 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  69.71 
 
 		 244 aa  347  9e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0593  two component transcriptional regulator  70.83 
 
 		 197 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.123862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.02 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  45.85 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  42.61 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  43.4 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  42.86 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 406 aa  184  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  39.15 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.7 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  40.34 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  41.74 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 228 aa  182  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  43.86 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 243 aa  181  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  42.61 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.18 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  39.74 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  40.25 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  42.04 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  43.7 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  41.81 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>